隔板上面也有小孔疏通着蛋黄水母身体液的流动。在它们的胃腔内,含有成百上千的刺细胞和腺细胞,随时等候着吞噬并杀死进入胃腔的猎物。不过,蛋黄水母还有一个神秘武器,那就是遍布全身的鱼叉状的触手。它们的触手浸泡在水中像大伞一样撑开来。其触手在触碰到猎物时,会直接射出刺细胞里面所拥有的毒液,被碰触到的微小浮游生物,会因为沾到触手上刺细胞的毒液而死亡。这也是蛋黄水母捕食的一种方式。
捕食完成后,它们会将食物送入到自己的胃部,胃丝腺细胞会通过分泌消化酶来分解消化食物,来针对食物完成进一步的消化,来增加它们形体发展的营养物的吸收。消化后的营养物靠环流管壁的纤毛摆动以推动营养物由胃腔经从辐管进入环管,再经正辐管、间辐管、胃腔及口将未消化吸收的食物残渣排出体外。蛋黄水母为雌雄异体,生殖腺位于胃襄内,由内胚层产生。原始的种类在隔板两侧共有8个生殖腺。在性成熟时,色泽较浓厚,易于识别。