近日，中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室包振民院士和王师教授团队在国际生物信息数据库领域知名期刊Nucleic Acids Research发表了题为“面向全球格局的海洋微生物综合多组学资源数据库—Ocean-M”的论文，正式发布了面向全球格局的海洋微生物综合多组学资源数据库—Ocean-M。Ocean-M数据库整合了全球多生境、多尺度的海洋微生物多组学数据，成为海洋微生物研究领域最全面的开放获取数据库。平台汇集了来自全球不同海洋生态系统的57,000余个微生物数据，涵盖宏基因组、宏转录组、宏蛋白质组、宏代谢组等多个层次，样本涵盖了从极地到赤道、从表层到深海的完整生态梯度。通过统一的数据处理和标准化标识符，Ocean-M整合了规模最大的宏基因组数据，包含超过50,000个代表性微生物基因组数据，支持全球范围内微生物群落结构、功能特征及其空间分布的可视化展示。Ocean-M构建了基于全息组学的生态网络分析框架，整合了微生物群落网络、宿主-微生物组互作及环境DNA数据集，能精确描述查询微生物群落结构、功能特征及其生态位相互关系，实现了生态互作的全维度分析，为生态学研究提供了全新的视角和工具。同时，搭建了“基因组-基因功能-生态偏好”三位一体的系统分析框架，通过大规模的功能基因挖掘，建立了包含百万级功能基因集合，为微生物功能基因的挖掘和生态系统功能解析提供了强有力的支持。
来源：中国海洋大学
